1944 gründete Karl Vötterle in Basel die erste ausländische Niederlassung des Verlages, um auch weiterhin die Rechte der Autoren zu sichern und deren Werke verbreiten zu können.

Es erschienen bei Bärenreiter Basel vor allem Werke Schweizer Komponisten wie Willy Burkhard, Klaus Huber, Rudolf Kelterborn, Beat Furrer, Andrea Lorenzo Scartazzini und Dieter Ammann.

Mit Beginn des Jahres 2021 wurden alle Basler Titel von Bärenreiter Kassel übernommen.